Perjuangan yang cukup panjang masyarakat Aceh Singkil terwujut menjadi kenyataan dengan keluarnya Undang-undang No. 14 Tahun 1999, tanggal 20 April, 1999, sehingga wilayah Aceh Singkil resmi menjadi Kabupaten Aceh Singkil dan sebagai Bupati pertama MAKMUR SYAH PUTRA, SH, yang dilantik di Jakarta pada tanggal 27 April 1999 oleh Menteri dalam Negeri.
Peresmian Kabupaten Aceh Singkil dilaksanakan oleh Gubernur Provinsi Daerah Istimewa Aceh (Prof.Dr, Syamsuddin Mahmud) pada tanggal 14 Mei 1999 dilapangan Daulat Singkil yang dihadiri oleh masyarakat Aceh Singkil yang berada di singkil dan yang berasal dari perantauan tumpah ruah penuh kebahagiaan dan keharuan, Raut wajah rakyat wilayah Aceh Singkil yang menghadiri acara peresmian tersebut terpancar perasaan puas, bangga serta bahagia. (Aceh Singkil dalam Angka 2010).
Dalam masa kurun waktu 1 (satu) tahun lebih Kabupaten Aceh Singkil menjadi Kabupaten definitif, baru pada tahun 2000 turun struktur dengan KMA Nomor 30 tahun 2000 tanggal 05 Agustus 2000, tentang Pembentukan Kantor Kementerian Agama Kota Dumai, Metro, Cilegon, Depok, Banjarbaru, Kabupaten Aceh Singkil, Mandailing Natal, Toba Samosir, Lampung Timur, Way Kanan, Bengkayang dan Luwu Utara dan dilantik Kepala Kantor Departemen Agama Kabupaten Aceh Singkil, dengan kepala Kantor yang perdana Rasyidin,B.BA, S.PdI, lahir di Aceh Selatan pada tanggal 04-04-1949, dalam masa bakti Kepemimpinannya sejak tahun 2000 s/d 2004, kemudian Kepemimpinannya dilanjutkan oleh Drs. Ramlan dengan masa bakti sejak tahun 2004 s/d 2010, selanjutnya diteruskan Kepemimpinannya oleh Drs. H. Herman sejak tahun 2011 s/d 30 Agustus 2013 diteruskan oleh Drs. Ramlan sejak 01 September 2013 dan diteruskan oleh Drs. Salihin sejak 03 Oktober 2013 sampai dengan sekarang.
Saat ini Kantor Kementerian Agama Kabupaten Aceh Singkil sudah berusia lebih kurang 15 (lima belas) tahun, usia yang masih muda belia, usia yang masih memerlukan bimbingan dan tuntunan serta usia yang terus menerus harus melakukan perubahan, pembinaan dan pengembangan Kelembagaan, sumber daya Manusia dan peningkatan Program Kementerian Agama untuk mencapai Visi dan Misi Kementerian Agama Kabupaten Aceh Singkil.